Určité množstvo metánu mohlo byť vyrobené anorganickými procesmi. Pôvodným zdrojom uhlíka Zeme boli kozmické úlomky, z ktorých vznikla planéta. Ak sú meteority reprezentatívne pre tento úlomok, uhlík mohol byť dodaný v pomerne vysokých koncentráciách ako uhľovodíky, aké sa nachádzajú v uhlíkatom type chondritov. Nepretržité odplyňovanie týchto uhľovodíkov môže prebiehať zvnútra Zeme a niektoré sa môžu nahromadiť ako usadeniny abiogénneho plynu bez toho, aby prešli organickou fázou. V prípade rozsiahleho odplynenia je však pravdepodobné, že abiogénny plyn by bol príliš difúzny na to, aby bol komerčným záujmom. Významné nahromadenie anorganického metánu sa ešte nepodarilo nájsť.
Hélium a časť argónu nachádzajúce sa v zemnom plyne sú produkty prirodzeného rádioaktívneho rozpadu. Hélium pochádza z rádioizotopov tória a skupiny uránu a argón pochádza z draslíka. Je pravdepodobne náhoda, že hélium a argón sa niekedy vyskytujú so zemným plynom; s najväčšou pravdepodobnosťou sa nesúvisiace plyny jednoducho chytili do rovnakej pasce.
